虽然大多数患有局限性前列腺癌的患者能够被治愈，但仍有部分患者出现了复发。 为解决以上问题，来自法兰克福大学医院和苏黎世大学的研究人员使用单细胞质谱流式细胞技术（CyTOF）以及基于Franken pipeline的深度聚类方法，对从58名患有局限性前列腺癌（LPC）的男性中分离的160多万个细胞进行了分析，以确定预后生物标记物，并描述前列腺癌及其相关微环境的异质性。研究强调了发生在肿瘤组织中的免疫格局特征，并确定了与疾病进展有关的罕见细胞亚群。研究成果“Single-cell proteomics defifines the cellular heterogeneity of localized prostate cancer”发表在Cell子刊《Cell Reports Medicine》。

银屑病是一种常见的慢性炎症性皮肤病。近年来，人们对人体皮肤免疫细胞的多样性和异质性进行了大量研究，但对人类银屑病免疫细胞分别在表皮和真皮的空间分布尚不清楚。 近期，浙江大学医学院附属第二医院皮肤科满孝勇主任团队在Cellular & Molecular Immunology（IF=22.10）在线发表题为“The epidermal immune microenvironment plays a dominant role in psoriasis development, as revealed by mass cytometry”的研究论文，该研究采用CyTOF技术，揭示了表皮免疫微环境在银屑病的发生发展中所起的主导作用。

据悉，身体感觉系统的精确控制发展对于检测疼痛、瘙痒、温度、机械触摸和身体位置是必不可少的。尽管体感神经元在成熟时已有较好的特征，但许多关于其发育的基本问题仍未解决。特别是，背根神经节（DRG）的中间祖细胞类型的特征仍然很差，控制细胞类型规范的分子图谱还没有定义。 近期，美国弗吉尼亚大学Eli R. Zunder和Christopher D. Deppmann研究团队利用CyTOF构建了躯体感觉多样化和成熟的发育图谱。该研究成果“A developmental atlas of somatosensory diversification and maturation in the dorsal root ganglia by single-cell mass cytometry”于2022年10月27日发表在国际一流学术期刊《Nature Neuroscience》。

单核细胞归巢到肝脏和与肝窦内皮细胞(LSECs)的黏附是非酒精性脂肪性肝炎(NASH)发病的关键因素，之前的研究表明VCAM-1介导单核细胞与LSECs的黏附。然而，VCAM-1在NASH中的致病作用尚不清楚。 鉴于此，美国妙佑医疗国际研究人员，通过多组学技术联合应用，发现脂毒应激部分通过MLK3信号增强LSEC VCAM-1的表达；利用CyTOF技术发现VCAM-1抗体通过减少单核细胞向肝脏的渗透来改善肝脏损伤、炎症和纤维化；抑制VCAM-1的表达可减轻小鼠的NASH的所有损害特征。研究成果“Lipid-induced endothelial vascular cell adhesion molecule 1 promotes nonalcoholic steatohepatitis pathogenesis”发表在期刊《The Journal of Clinical Investigation》。

质谱流式细胞技术作为最前沿的单细胞蛋白检测技术，能够通过少量组织或血液样本，精准高效地挖掘不同疾病关键性的细胞蛋白水平动态变化信息，结合前沿单细胞生信分析技术，为药物研发者提供高分辨率下的病人免疫表征，从而寻找出更有效的靶标，降低临床试验风险，加快整体研发进度与药物上市进程。为此，普罗亭整理了近期质谱流式技术在临床0-4期研究阶段的相关文献，在这里与各位医药研发同行分享。

越来越多的证据表明新冠病毒感染引起的免疫反应会导致新冠病毒相关的免疫病理状态，尤其是在重症患者中有更明显的病理损伤。 为了鉴定T细胞是否参与了免疫病理或者哪一亚类的T细胞导致免疫损伤，德国柏林大学研究团队将单细胞蛋白组（CyTOF）与单细胞转录组（scRNA-seq）技术相结合，评估COVID-19重症过程中致病T细胞的功能和诱导信号，发现活化的CD16+T细胞比例和C3a补体蛋白水平与新冠肺炎的致死结局相关，支持新冠肺炎中细胞毒性和补体激活加剧的病理作用。文章“Complement activation induces excessive T cell cytotoxicity in severe COVID-19”发表在期刊《Cell》。