单细胞测序服务

快速进行单细胞的标记、建库、测序和分析,高效获得上万个单细胞的基因表达谱。

技术原理
10X Genomics 单细胞转录组测序平台利用微流控和 barcode 标记等技术,捕获近十万个细胞,从而获得大量的转录组信息。该过程通量高、成本低、周期短。
技术特点

通量高

一次测序,同时可检测8个通道,每个通道一次可捕获10000个细胞,一次实验可分选标记80000个细胞

超多维度

单个细胞捕获效率高达65%

周期短

完成上万个细胞封装仅需6分钟内,完成单细胞悬液、细胞捕获、扩增以及建库仅需1天

范围广

可以广泛应用于个体异质性、免疫微环境、神经科学、胚胎发育、细胞分化等领域的研究

精度高

真正意义上实现对单个细胞的测序,每一个细胞形成单独的GEMs

类型多

细胞类型多样化,对细胞大小要求低(适宜40 μm直径以内),无下限

应用方向

人类细胞图谱构建

获得人体单细胞的转录组图谱,探索人体细胞复杂的基因网络在单个细胞中的运作机制,并了解各个细胞中这些网络的差辞,以及各种细胞群体最终如何协同工作

肿瘤异质性研究

进行肿瘤细胞异质性研究、肿瘤细胞分群以及新类型细胞的发现,寻找新的致病途径和机制

免疫方向研究

获得人体单细胞的转录组图谱,探索人体细胞复杂的基因网络在单个细胞中的运作机制,并了解各个细胞中这些网络的差辞,以及各种细胞群体最终如何协同工作

发育生物学:胚胎、神经、脑等

可以细胞不同亚型的特征进行研究,构建细胞谱系,预测分化方向

干细胞发育及分化

干细胞发育及分化

疾病分型

用于发现发生异常增殖的细胞类型,结合传统病理学特征,辅助疾病分型

服务流程
普罗亭采用多对一的项目合作模式,针对单个项目建立包含多名专业技术人员的专项团队。
深入了解客户需求,从合同签订到结项报告全流程有效沟通并严格质控。提供更加专业、放心的质谱流式完整解决方案。
样本类型

人源样本包括肝癌、肺癌、胃癌等癌组织和斑块、血管、 皮肤等非癌组织。

小鼠样本包括小肠癌、直肠癌、黑色素瘤等癌组织和脑膜,心脏、骨髓等非癌组织。

涉及实体瘤、血液病、自身免疫病、心血管疾病、呼吸系统疾病等多个领域,每年检测量超10000例。

数据分析
普罗亭生信分析团队的核心科学家博士毕业于美国拥有顶级生物医学工程专业的佐治亚理工学院,
核心算法的系列软件均为自主研发,拥有正式授权的软件著作权50项。
能够为客户提供定制化的数据挖掘方案,满足多样化的数据分析挖掘需求。
UMAP
降维可视化展示不同cluster、group细胞以及marker表达的空间分布
Frequency bar
展示不同group间不同cluster细胞数量的占比
correlation
展示细胞群之间的相关性
Violin plot
展示基因在各个样本中的表达情况
Dotplot
统计学分析出不同group间差异的细胞表型
Volcano plot
展示基因的差异表达情况
3D Pseudotime
拟时序分析细胞群体发育轨迹
Pseudotime
Pseudotime预测细胞的分化及发育轨迹
GO/KEGG Enrichment
系统分析基因产物在细胞中的代谢途径及其功能
Interaction network map
Interaction network map差异基因蛋白网络互作分析
heatmap
heatmap展示亚群cluster与其marker表达模式
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